10月26日，代表团一行访问了中华人权协会并进行座谈，中华人权协会理事长李永然、常务理事查重传等会见了代表团并出席座谈，座谈期间双方表示大陆和台湾应在人权方面增加互访、加深交流、相互学习。朱光磊在会谈中介绍了南开大学的人权研究中心及其人权研究成果，并表示南开大学作为大陆人权教育基地之一，在人权方面愿与台湾积极开展合作。李永然对南开大学在人权研究、特别是人权普及教育方面的工作给予了高度赞赏，并就人权指数调查做了简要报告。

　　10月27日上午，代表团一行访问了长庚大学。长庚大学校长包家驹对代表团一行表示欢迎，重点介绍了长庚医学院和分子医学研究中心的情况，表示希望与南开大学在医学领域积极开展科研合作。会见后，代表团一行参观了长庚大学分子医学研究中心及台塑企业文物馆。

　　10月27日下午，代表团一行访问了台湾大学。会谈中，两校医学院在科研教学、临床研究以及交换学生等方面达成了合作共识，并决定由南开大学医学院与台湾吴大猷基金会每年、定期共同召开医学国际会议。会谈后，代表团参观了台湾大学附属医院。

　　南开大学分别在2008年和2012年与台湾大学和长庚大学签署了校际交流协议和学生交换协议。